El grupo denominado clásicamente «Cianofíceas o Cianofitas» (e incluido dentro de las microalgas dulceacuícolas) es denominado ahora Cianobacterias o Cianoprocariotas, dada la naturaleza procariótica de sus células. Las especies predominantes en el plancton de todas las masas de agua de Sanabria son coloniales y de pequeño tamaño. Asimismo se agrupan en una matriz gelatinosa que puede ser más o menos aparente a la luz directa del microscopio. A pesar de su pequeño tamaño pueden representar una fracción importante del biovolumen algal, y funcionalmente también dado que muchas especies son capaces además de fijar N2 atmosférico. De esta manera pueden proliferar en aguas ricas en fósforo, ya que no son limitadas por la ausencia del otro gran nutriente limitante en el agua dulce (el N).

Las microalgas del grupo Clorofitas deben su nombre a su color verde más o menos intenso, a pesar de la presencia de otros pigmentos aparte de la clorofila de tipo «a» en su contenido celular.

Las algas del grupo Ochrofitas deben su nombre a su color ocre (dorado hasta pardo), a pesar de la presencia de clorofila de tipo a y c en su contenido celular. Tienen un aparato flagelar muy típico provisto de dos filas de mastigonemas proyectados en ángulo recto respecto al eje del flagelo. En las especies que presentan un segundo flagelo, éste es menor y además no presenta mastigonemas. También es característico un órgano fotorreceptor en la zona basal del aparato flagelar.

Las microalgas del grupo Desmidiáceas, Desmidiales en sentido amplio, tienen una gran riqueza de especies en las aguas húmicas de lagunas, embalses y el lago de Sanabria. Especialmente en las zonas próximas al litoral ya que se desarrollan y reproducen principalmente sobre la vegetación sumergida y los musgos de las orillas. Si bien no son estrictamente bentónicas ya que no tienen estructuras de fijación al sustrato.
Su elevado contenido en clorofila por célula, y el tamaño grande de muchas de las especies les confieren gran responsabilidad en la biomasa algal total y en la cantidad de clorofila de los ecosistemas.

Las algas del grupo Diatomeas, llamadas Bacillariofíceas en sentido amplio, tienen como característica morfológica distintiva más importante que se rodean de un caparazón silíceo de dos valvas (o frústulos) con ornamentación muy variada. Comparten otras características con el resto de las Ochrofitas pero sólo los gametos poseen flagelos.
Por su naturaleza mineral los frústulos permanecen en los sedimentos lacustres después de la muerte de las células por lo que son muy usados como indicadores en paleolimnología.